More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
287 aa  573  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.28 
 
 
275 aa  351  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  64.07 
 
 
274 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  62.87 
 
 
273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  62.36 
 
 
274 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  63.33 
 
 
271 aa  321  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  63.33 
 
 
271 aa  321  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  63.33 
 
 
271 aa  321  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.81 
 
 
281 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
270 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
280 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
280 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.16 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 
270 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  43.07 
 
 
273 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.78 
 
 
270 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  42.54 
 
 
270 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  43.28 
 
 
270 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
270 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.61 
 
 
967 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  41.33 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
276 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.87 
 
 
279 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
291 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
277 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
283 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  37.12 
 
 
280 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
280 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
286 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  39.11 
 
 
278 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
247 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  34.78 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  40.67 
 
 
258 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
261 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
263 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
259 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.48 
 
 
657 aa  138  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
258 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  30.88 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 
253 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.72 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.35 
 
 
657 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.73 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.6 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  33.82 
 
 
261 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
268 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
265 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
264 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
260 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
257 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.34 
 
 
663 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
257 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 
258 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
258 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
272 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
255 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.23 
 
 
661 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.27 
 
 
659 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
258 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
260 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  33.09 
 
 
261 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
256 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
261 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 
257 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
258 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
260 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
253 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.15 
 
 
260 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
260 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.25 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.38 
 
 
662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.03 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>