More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  65.67 
 
 
207 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  66.67 
 
 
208 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  65.84 
 
 
203 aa  248  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  65.67 
 
 
208 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  47.54 
 
 
198 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  47.54 
 
 
198 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  38.97 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  38.97 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  38.97 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  38.25 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  42.61 
 
 
202 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.7 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  39.49 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  34 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  34 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.22 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.91 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  35.14 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
355 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.67 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.67 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.67 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.67 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.38 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.38 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
250 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.99 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  32.21 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.3 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
257 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.87 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.8 
 
 
235 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  32.85 
 
 
347 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
269 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
258 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.91 
 
 
205 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  37.04 
 
 
216 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  37.04 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  36.62 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.94 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.16 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.03 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  38.68 
 
 
263 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
331 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.51 
 
 
258 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32 
 
 
266 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
286 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  32.41 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04683  methyltransferase  35.77 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
250 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.97 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
260 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
320 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
238 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
239 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.38 
 
 
257 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5453  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.04 
 
 
389 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.71 
 
 
541 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.93 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
328 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
328 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
328 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
350 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
341 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>