More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 278 aa  563  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  68.7 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  37.83 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  29.57 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  31.23 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 		 242 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  30.17 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  29.39 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.25 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  27.16 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  27.16 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  27.16 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 231 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  26.76 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  33.91 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 368 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  23.53 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  23.21 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  26.63 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  29.13 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  22.22 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  22.6 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  22.6 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  22.6 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.89 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.6 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  23.04 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>