234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  46.3 
 
 		 272 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  37.6 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  34.06 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.46 
 
 		 637 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  36.4 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  32.46 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  32.46 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.96 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  30.71 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  28.74 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.37 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  29.2 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.9 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.88 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.79 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.96 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 346 aa  75.5  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  28.02 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.64 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.5 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  28.69 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 308 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 313 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  28.46 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  31.47 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.31 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.13 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.41 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.51 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 321 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  36.52 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  28.96 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  26.96 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>