266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08100  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3810  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  62.64 
 
 		 214 aa  230  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4581  phosphoheptose isomerase  58.67 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  45.86 
 
 		 232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  45.86 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  47.13 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3209  phosphoheptose isomerase  40.48 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  47.44 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  41.92 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  37.64 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  32.73 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  37.29 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  37.36 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  39.22 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  35.68 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3233  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  40.62 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  31.94 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  37.1 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  36.96 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  31.98 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  35.93 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  32.32 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  27.87 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  29.67 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  30.27 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  36.25 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  31.71 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  34.04 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  35.2 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  33.51 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2616  phosphoheptose isomerase  40.23 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.403482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  34.41 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  30.94 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  32.45 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  34.04 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  32.78 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  32.45 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1347  phosphoheptose isomerase  26.67 
 
 		 302 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.19661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  34.08 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  33.14 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  29.19 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  44.19 
 
 		 391 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  35.22 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  36.72 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  33.51 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  32.78 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4583  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  43.14 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  31.52 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  32.98 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  34.68 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  27.51 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  29.38 
 
 		 186 aa  98.6  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  33.51 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  32.64 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  32.05 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  38.92 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  28.12 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  31.07 
 
 		 356 aa  95.5  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  33.55 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  32.96 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  37.75 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  31.06 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  32.93 
 
 		 188 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  33.93 
 
 		 191 aa  94.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  31.61 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 358 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  33.15 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  35.95 
 
 		 358 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  32.11 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  32.02 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>