More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0858 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 295 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  48.48 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  48.48 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  48.48 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  51.52 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 		 297 aa  278  7e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  49.16 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.9 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  36.55 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  38.19 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  37.05 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  40.55 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  36.63 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.4 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.1 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  33.68 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  42.23 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  41.98 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  36.1 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  38.32 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.98 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  41.06 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  32.95 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 331 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 322 aa  148  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.24 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  36.32 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.97 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  31.82 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  41.26 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  40.48 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  40.85 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  39.25 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.89 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.9 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  35.41 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  42.72 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  41.38 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  35.66 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  37.14 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.51 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  38.21 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.42 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.37 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  42.72 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  40.29 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.94 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.8 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  42.72 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  39.91 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  36.58 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  39.53 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  39 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.94 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.1 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.84 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  30.56 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  36.15 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  37.56 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  40.95 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.32 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  34.53 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  42.29 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  42.29 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  42.29 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  42.29 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  42.29 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  42.29 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  37.24 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  38.57 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  41.38 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  39.6 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  33.71 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  38.57 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>