51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1266 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 114 aa  233  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  67.57 
 
 		 110 aa  169  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  48.65 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  50 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  47.75 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  47.75 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  44.14 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  47.79 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  42.98 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  45.54 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  38.6 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  38.6 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.6 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  44.14 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  43.24 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  37.61 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  33.03 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  37.61 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  40 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.05 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  35.45 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  38.39 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  35.71 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  42.05 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  34.21 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  32.73 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  34.86 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  36.61 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  35.71 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  34.51 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  35.23 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  35.78 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  30.89 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  35.14 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  33.63 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  37.04 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  29.06 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119611  DNA-directed RNA polymerase II subunit 9, probable  29.73 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  29.91 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  33.62 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  46 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  35.09 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.6 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  31.58 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04219  RNA polymerase III subunit C11, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06380)  30.56 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267157  normal  0.568074 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  36.84 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  45.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  33.33 
 
 		 173 aa  42  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  27.52 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  28.32 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  38.6 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>