More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3269 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  100 
 
 		 600 aa  1247    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 481 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  45.6 
 
 		 629 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 807 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.9 
 
 		 655 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 632 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  39.83 
 
 		 914 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  46.94 
 
 		 339 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.24 
 
 		 982 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 		 1131 aa  171  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 893 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 897 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  46.29 
 
 		 632 aa  160  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  42.49 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.1 
 
 		 880 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.1 
 
 		 860 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 357 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 462 aa  157  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 357 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 357 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.55 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  40.98 
 
 		 648 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 		 339 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.54 
 
 		 343 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 		 368 aa  153  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 		 770 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 		 718 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  39.23 
 
 		 876 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 		 389 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  35.17 
 
 		 498 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 		 326 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 618 aa  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 		 719 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.14 
 
 		 491 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  41.71 
 
 		 771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  35.4 
 
 		 308 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  33.88 
 
 		 374 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 		 371 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 424 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  33.33 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 		 177 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 505 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  38.59 
 
 		 649 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 363 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  39.78 
 
 		 453 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 		 210 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 		 1171 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 508 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  40.74 
 
 		 351 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  41.44 
 
 		 212 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  45.12 
 
 		 220 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 320 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 		 405 aa  145  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 		 718 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 		 347 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  37.31 
 
 		 848 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 		 212 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  43.03 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 		 650 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 		 518 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  42.01 
 
 		 331 aa  143  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 571 aa  143  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 		 471 aa  143  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  31.2 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  31.2 
 
 		 377 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  31.2 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 378 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  31.2 
 
 		 377 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 		 357 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.05 
 
 		 841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  31.2 
 
 		 373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  40 
 
 		 836 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  37.77 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 905 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  37.7 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  41.57 
 
 		 712 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.05 
 
 		 353 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>