More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0197 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  79.41 
 
 		 529 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  65.36 
 
 		 531 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  72.32 
 
 		 541 aa  798    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  68.79 
 
 		 534 aa  752    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  83.11 
 
 		 540 aa  917    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  93.07 
 
 		 530 aa  1011    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  82.08 
 
 		 534 aa  894    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  79.41 
 
 		 527 aa  853    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  69.22 
 
 		 543 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  93.45 
 
 		 530 aa  1015    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  71.48 
 
 		 538 aa  806    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  71.48 
 
 		 538 aa  806    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  60.22 
 
 		 531 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  93.52 
 
 		 540 aa  1013    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0315  cytochrome-c oxidase  68.6 
 
 		 534 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  79.81 
 
 		 527 aa  871    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  78.42 
 
 		 536 aa  857    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  72.9 
 
 		 526 aa  799    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  77.26 
 
 		 530 aa  853    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  69.5 
 
 		 543 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  80 
 
 		 530 aa  853    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  69.88 
 
 		 539 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  86.68 
 
 		 546 aa  948    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  66.16 
 
 		 524 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  68.31 
 
 		 544 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  69.14 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  96.44 
 
 		 534 aa  1022    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  65.36 
 
 		 531 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  93.07 
 
 		 531 aa  1009    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3046  cytochrome c oxidase  66.6 
 
 		 532 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000491174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  78.43 
 
 		 530 aa  843    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  79.22 
 
 		 529 aa  847    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  69.01 
 
 		 556 aa  732    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  69.9 
 
 		 535 aa  744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  70.18 
 
 		 543 aa  738    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  88.11 
 
 		 543 aa  933    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  93.45 
 
 		 530 aa  1015    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  69.71 
 
 		 535 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  68.62 
 
 		 544 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  92.7 
 
 		 530 aa  1011    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  79.22 
 
 		 529 aa  847    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  69.94 
 
 		 535 aa  749    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  73.39 
 
 		 526 aa  766    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  66.6 
 
 		 535 aa  730    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  71.86 
 
 		 529 aa  780    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  66.15 
 
 		 569 aa  707    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  65.96 
 
 		 550 aa  728    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  69.9 
 
 		 535 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  68.4 
 
 		 537 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  60.49 
 
 		 533 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 535 aa  762    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  66.73 
 
 		 539 aa  727    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  77.04 
 
 		 516 aa  828    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  67.57 
 
 		 544 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  68.4 
 
 		 537 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  91.96 
 
 		 535 aa  1003    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  93.45 
 
 		 531 aa  1015    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  68.97 
 
 		 534 aa  748    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  68.15 
 
 		 534 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  70 
 
 		 536 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  92.35 
 
 		 536 aa  1002    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  68.23 
 
 		 544 aa  727    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  69.71 
 
 		 535 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  68.96 
 
 		 535 aa  760    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  69.01 
 
 		 547 aa  738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  87.11 
 
 		 532 aa  907    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  79.61 
 
 		 529 aa  850    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 534 aa  1078    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  93.82 
 
 		 530 aa  1016    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  94.01 
 
 		 530 aa  1020    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  75.92 
 
 		 526 aa  811    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  91.39 
 
 		 531 aa  992    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  86.52 
 
 		 537 aa  910    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  69.71 
 
 		 535 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  80.39 
 
 		 530 aa  856    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  93.45 
 
 		 530 aa  1015    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  69.71 
 
 		 535 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  93.82 
 
 		 530 aa  1018    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  68.97 
 
 		 534 aa  748    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  67.64 
 
 		 544 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 		 537 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  55.66 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  53.38 
 
 		 532 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  56.02 
 
 		 537 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  55.41 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  56.45 
 
 		 541 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  54.47 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  51.55 
 
 		 555 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  54.7 
 
 		 542 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  55.56 
 
 		 542 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  55.3 
 
 		 542 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  54.51 
 
 		 542 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  55.19 
 
 		 540 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  53.86 
 
 		 559 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>