197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8407 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  65.77 
 
 
333 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  50.66 
 
 
324 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  55.41 
 
 
322 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.69 
 
 
331 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  41.42 
 
 
310 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.97 
 
 
335 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  39.05 
 
 
351 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  35.6 
 
 
365 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  33.77 
 
 
342 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  33.63 
 
 
359 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
348 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  33.7 
 
 
357 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
331 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  32.88 
 
 
320 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.17 
 
 
328 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  32.04 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  34.38 
 
 
356 aa  92.4  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.11 
 
 
316 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  35.32 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.19 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  35.39 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  27.27 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  31.88 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.25 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.41 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  22.07 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  22.15 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  32.62 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.45 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.83 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.97 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  29.37 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  21.4 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  21.4 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  21.4 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  29 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  31.91 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  36.69 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  35.62 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  31.91 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  29.24 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.51 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  20.81 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  35.62 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  35.62 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.2 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  20.19 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  21.18 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.2 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.2 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  32.55 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  29.37 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.83 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.45 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.63 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.35 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.14 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  26.85 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  31.03 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  33.79 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3133  hypothetical protein  30.74 
 
 
288 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786366  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.36 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.18 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  31.76 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  31.76 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  31.76 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  31.76 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25.11 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  25.54 
 
 
219 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25.11 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  28.94 
 
 
358 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.85 
 
 
293 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  28.63 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>