More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8025 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 
465 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 
477 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  69.44 
 
 
469 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
455 aa  931    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  80.88 
 
 
455 aa  740    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  69.96 
 
 
481 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 
475 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 
463 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 
471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 
500 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 
470 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
468 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
479 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
468 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
477 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
491 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
491 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
468 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
466 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
466 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
490 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
490 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
490 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
472 aa  329  7e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
490 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
494 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
466 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
463 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
501 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
492 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
471 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.66 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
472 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
473 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
493 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
469 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
478 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
490 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
492 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
494 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
504 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
490 aa  306  7e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
512 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3604  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
498 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
480 aa  303  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
475 aa  302  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
472 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
495 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
469 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
466 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
469 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
469 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
469 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
469 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
469 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
466 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
471 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
474 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
469 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
488 aa  298  9e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
471 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
468 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
490 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
471 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>