210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7977 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  984    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  42.9 
 
 		 445 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  69.93 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  69.93 
 
 		 336 aa  213  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  54.75 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  52.5 
 
 		 392 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  48.47 
 
 		 456 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  46.15 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  29.43 
 
 		 339 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.5 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  29.15 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  28.06 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  28.9 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 		 345 aa  103  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.38 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1667 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  26.8 
 
 		 329 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  28.32 
 
 		 324 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.14 
 
 		 329 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.23 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  26.14 
 
 		 329 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  25.16 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  27.78 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  25.82 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  25.82 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  25.82 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  27.73 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  23.03 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  30.91 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  31.01 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.16 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.42 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.03 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.44 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.07 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.71 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  31.68 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.76 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.97 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  24.66 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.59 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.45 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  29.93 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 689 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.63 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.63 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.09 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.63 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.69 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.1 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.8 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.59 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  27.61 
 
 		 387 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.33 
 
 		 328 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.35 
 
 		 1094 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.39 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  27.94 
 
 		 580 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.47 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.81 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  27.27 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.46 
 
 		 752 aa  63.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.04 
 
 		 328 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.2 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 354 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  33.58 
 
 		 1189 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.79 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  21.54 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1170 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.53 
 
 		 353 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.58 
 
 		 366 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.61 
 
 		 974 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.97 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.94 
 
 		 328 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.67 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.74 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.62 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  36.46 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.32 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.83 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.37 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.08 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.89 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6221  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.2 
 
 		 810 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  34.62 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>