46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7410 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  769    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  39.16 
 
 		 485 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  36.19 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  35.94 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  30.72 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  36.84 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  30.56 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  45.89 
 
 		 521 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.16 
 
 		 945 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  29.17 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  37.58 
 
 		 704 aa  80.1  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  37.14 
 
 		 727 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  32.79 
 
 		 641 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  33.97 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  24.84 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  29.24 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  29.76 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  34.25 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  51.72 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  29.96 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  27.11 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  34.93 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  41.89 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  26.21 
 
 		 731 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  30.82 
 
 		 557 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  24.7 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  31.84 
 
 		 646 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  28.48 
 
 		 647 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  24.51 
 
 		 489 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  27.51 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  25.4 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  24 
 
 		 732 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1861  hypothetical protein  39.19 
 
 		 229 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  28.78 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  26.42 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.94 
 
 		 846 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>