130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6466 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  54.05 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  53.18 
 
 		 253 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  47.51 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  50.67 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  53.6 
 
 		 232 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  50.67 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  52.04 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  49.77 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  44.27 
 
 		 155 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  43.41 
 
 		 172 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  44.3 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  44.7 
 
 		 150 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  35.42 
 
 		 169 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  34.33 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  35.11 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  33.6 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  55.07 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  26.87 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  25.9 
 
 		 160 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  31.5 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 386 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  24.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  55.32 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  49.3 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  49.3 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  49.3 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  49.3 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  49.3 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  36.14 
 
 		 153 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  37.74 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  41.98 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 386 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  43.08 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 163 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  25.19 
 
 		 152 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  37.21 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  42.39 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  42.05 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  46.88 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  43.28 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  40.45 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  40.45 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  49.15 
 
 		 385 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 466 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  49.15 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  48.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  48.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  48.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>