150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2718 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  61.64 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  37.97 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  37.97 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  38.16 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  38.18 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  38.18 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  31.31 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  31.31 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  34.15 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  32.13 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  26.8 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  32.93 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  31.32 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  28.35 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  31.06 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  26.19 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  26.19 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  26.52 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  30.29 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  37.73 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  34.25 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  27.89 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  29.61 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  25.59 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  33.87 
 
 		 271 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  31.3 
 
 		 261 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  33.9 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  30.34 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  28.4 
 
 		 256 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  28.17 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  29.93 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  27.04 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  34.4 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  30.23 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  30.66 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  35.37 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  31.34 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  24.54 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  27.92 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  31.07 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  33.49 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  36.64 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  35.71 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  31.47 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  33.16 
 
 		 273 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  26.35 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  30.88 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  31.31 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  30.11 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  32.66 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  24.6 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  28.25 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  29.45 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  25.99 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  35.37 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  24.62 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  29.74 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  23.91 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  32.52 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  32.67 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  26.05 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  27.57 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  30.99 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  30.98 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  29.35 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  26.67 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  28.34 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  29.03 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  30.5 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  33.77 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  28.85 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  33.77 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  24.44 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  30.81 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  28.43 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  26.89 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  34.25 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  29.96 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  26.75 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  28.5 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  29.57 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  28.62 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  34.43 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  26.37 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  26.3 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  29.81 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  30.35 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  28.62 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  31.43 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>