50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2612 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  69.28 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  50.68 
 
 		 365 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  49.07 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  40.84 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  40.65 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  38.38 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  53.14 
 
 		 520 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  35.52 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  39.38 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  44.7 
 
 		 506 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  40 
 
 		 518 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  31.82 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  31.39 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  30.9 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  33.74 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  31.4 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  30.37 
 
 		 310 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  33.06 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  26.92 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  29.96 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  26.91 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  28.15 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  30.04 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  28.64 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  28.48 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  27.86 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  24.32 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  28.88 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  29.47 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  29.02 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  29.83 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  40.66 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  25.17 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  28.33 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  28.44 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.67 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  30.37 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  28.45 
 
 		 301 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  25.1 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  26.62 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  26.5 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  26.26 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  26.62 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  29.37 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  29.41 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  32.93 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>