71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0395  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 801 aa  1536    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4612  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.92 
 
 		 943 aa  346  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0211251  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0182  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  48.1 
 
 		 825 aa  239  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0480  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.39 
 
 		 1321 aa  229  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6377  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.22 
 
 		 892 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1702  sigma-70 region 2 domain-containing protein  47.23 
 
 		 466 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4220  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.97 
 
 		 2330 aa  194  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.184212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06010  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.53 
 
 		 828 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0206  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.58 
 
 		 1441 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.72 
 
 		 531 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00830  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  39.59 
 
 		 470 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0062  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.81 
 
 		 489 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0296  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.58 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166156  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34250  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  35.62 
 
 		 850 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.137913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5166  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.27 
 
 		 505 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0248944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  34.6 
 
 		 3921 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.33 
 
 		 831 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  29.35 
 
 		 1293 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  30.47 
 
 		 1129 aa  78.2  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  26.14 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  29.26 
 
 		 5017 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  21.83 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  29.26 
 
 		 5017 aa  58.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  29.26 
 
 		 5017 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  29.26 
 
 		 5010 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  29.26 
 
 		 5017 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  29.26 
 
 		 5017 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08330  hypothetical protein  26.34 
 
 		 263 aa  54.7  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0824478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4469  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.34 
 
 		 191 aa  55.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00981278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  29.26 
 
 		 5010 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  30 
 
 		 2490 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.38 
 
 		 5010 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1554  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.69 
 
 		 220 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2611  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.91 
 
 		 184 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  28 
 
 		 1108 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  29.18 
 
 		 5010 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  30 
 
 		 2490 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 2490 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  28.32 
 
 		 2358 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2492  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.93 
 
 		 270 aa  51.2  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.595064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  28.32 
 
 		 2358 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2490 aa  51.2  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  28.12 
 
 		 2490 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0782  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3277  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 259 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  24.9 
 
 		 3373 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  29.55 
 
 		 2485 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0425  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  29.2 
 
 		 2487 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.77 
 
 		 224 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1187  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0014  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0756  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.92 
 
 		 204 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1154  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0146  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1413  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1500  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.47 
 
 		 173 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1107  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.94 
 
 		 226 aa  48.9  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.71 
 
 		 257 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1793  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.06 
 
 		 189 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1387  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.28 
 
 		 173 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00286946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0538  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.97 
 
 		 212 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.104209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1709  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.57 
 
 		 172 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  28.64 
 
 		 2490 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  27.4 
 
 		 2025 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  25.36 
 
 		 5298 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0727  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.23 
 
 		 171 aa  45.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0906703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0744  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.23 
 
 		 171 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2784  sigma-24 (FecI)  34.91 
 
 		 176 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2489 aa  44.3  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1575  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.58 
 
 		 193 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>