More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0298 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  35.99 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  35.64 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  35.64 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  36.24 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  32.54 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  31.21 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  30.85 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  32.54 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  32.54 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  32.54 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  31.9 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.11 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  26.89 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.76 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  29.61 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  30.5 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  26.15 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.2 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  26.97 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  26.5 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  27.09 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.36 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  26.3 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  27.71 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  23.38 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  24.53 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.93 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  31.17 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  24.69 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  25.55 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.23 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  30.42 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  27.2 
 
 		 670 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  24.38 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.86 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  25.94 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  25.62 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.26 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.79 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.78 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.73 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  29.65 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  23.93 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.21 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  25.52 
 
 		 644 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  25.77 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  26.03 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.23 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.01 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.37 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.78 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  27.95 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.53 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.24 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.12 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.99 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  25.84 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  27.37 
 
 		 647 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  24.6 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  27.95 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.62 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  29.39 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  28.33 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.01 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.69 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  28.37 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  26.05 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  24.79 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  27.99 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.49 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 655 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  23.82 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  25.21 
 
 		 407 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  25.75 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27.27 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  28.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>