More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3979 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  57.71 
 
 		 747 aa  862    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  57.58 
 
 		 747 aa  842    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  59.57 
 
 		 729 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  57.47 
 
 		 745 aa  853    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  100 
 
 		 729 aa  1506    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  57.71 
 
 		 747 aa  861    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  56.94 
 
 		 752 aa  853    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  58.66 
 
 		 747 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  59.64 
 
 		 729 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  58.52 
 
 		 747 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  57.58 
 
 		 747 aa  859    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  61.48 
 
 		 703 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  57.58 
 
 		 747 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  61.48 
 
 		 703 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  58.62 
 
 		 747 aa  858    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  60.45 
 
 		 729 aa  889    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  59.7 
 
 		 729 aa  880    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  44.59 
 
 		 820 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  44.96 
 
 		 828 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  44.59 
 
 		 794 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  45.11 
 
 		 828 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  44.53 
 
 		 828 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 		 797 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.56 
 
 		 833 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  40.51 
 
 		 740 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 748 aa  532  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 		 736 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  41.42 
 
 		 819 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  41.47 
 
 		 717 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  43.06 
 
 		 778 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  42.69 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 701 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  41 
 
 		 705 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  40.98 
 
 		 714 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  39.49 
 
 		 735 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39.52 
 
 		 806 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  40.9 
 
 		 808 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  40.14 
 
 		 797 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  39.55 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  41.51 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  39.55 
 
 		 696 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  39.41 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  41.31 
 
 		 733 aa  502  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  41.98 
 
 		 821 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  40.73 
 
 		 806 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  39.41 
 
 		 698 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 		 810 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 696 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  40.36 
 
 		 753 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  39.13 
 
 		 696 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  41.51 
 
 		 801 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  40.5 
 
 		 750 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 		 789 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  39.72 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  39.31 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 		 808 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  38.27 
 
 		 705 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  41.08 
 
 		 771 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 802 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  41.04 
 
 		 817 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  40.72 
 
 		 771 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 799 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 		 822 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  40.78 
 
 		 812 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  37.98 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  39.27 
 
 		 828 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.01 
 
 		 689 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 745 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 		 831 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 		 715 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 750 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  37.83 
 
 		 724 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  39.64 
 
 		 769 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  38.09 
 
 		 738 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  38.38 
 
 		 747 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 799 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 		 745 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 		 752 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 		 741 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  37.79 
 
 		 753 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 		 713 aa  436  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 		 736 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 791 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  38.81 
 
 		 791 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  37.79 
 
 		 753 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 		 736 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  39.45 
 
 		 740 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 		 744 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 		 744 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 		 753 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 745 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 		 734 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 750 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 721 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 757 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 		 717 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>