More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3218 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 503 aa  1021    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  74.35 
 
 		 503 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  79.69 
 
 		 513 aa  830    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  78.92 
 
 		 518 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1135  ABC transporter related  70.42 
 
 		 500 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  73.16 
 
 		 503 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  73.36 
 
 		 503 aa  749    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  74.55 
 
 		 503 aa  779    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  47.38 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  43.17 
 
 		 515 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.51 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  42.51 
 
 		 509 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.37 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.9 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.72 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.18 
 
 		 496 aa  362  6e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  39.03 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  36.98 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.28 
 
 		 504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  39.23 
 
 		 509 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 512 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  38.78 
 
 		 499 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.8 
 
 		 513 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.74 
 
 		 507 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.2 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.64 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.64 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.49 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.54 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.09 
 
 		 494 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39.92 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  38.46 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.74 
 
 		 499 aa  352  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.74 
 
 		 499 aa  352  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.68 
 
 		 514 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  39.92 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.09 
 
 		 517 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  40 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  40.71 
 
 		 519 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 497 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  38.71 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  38.71 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.92 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  40.33 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  38.71 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.11 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 517 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  38.63 
 
 		 504 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  37.73 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  38.8 
 
 		 517 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  38.8 
 
 		 517 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  39.72 
 
 		 517 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  39.72 
 
 		 517 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  39.72 
 
 		 517 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  37.65 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  38.59 
 
 		 508 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  38.27 
 
 		 501 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  39.43 
 
 		 506 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  36.82 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  38.08 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  38.2 
 
 		 500 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.93 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  37.22 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  37.88 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.01 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  36.77 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.03 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  39.03 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  36.44 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  36.35 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 515 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.32 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  37.73 
 
 		 505 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  39 
 
 		 517 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.88 
 
 		 507 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.17 
 
 		 513 aa  343  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>