73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2485 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1337    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  59.56 
 
 		 636 aa  748    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  59.56 
 
 		 636 aa  748    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  63.34 
 
 		 637 aa  819    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  63.34 
 
 		 637 aa  819    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  69.35 
 
 		 647 aa  910    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  31.99 
 
 		 616 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  28.79 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  28.76 
 
 		 633 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  28.71 
 
 		 632 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  26.7 
 
 		 641 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  27.97 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  27.8 
 
 		 638 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  26.37 
 
 		 639 aa  210  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  26.92 
 
 		 634 aa  210  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  26.58 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  26.4 
 
 		 634 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  27.16 
 
 		 637 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  27.35 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  27.35 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  26.85 
 
 		 647 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  26.85 
 
 		 647 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 665 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  27.15 
 
 		 588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  27.75 
 
 		 626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  27.75 
 
 		 632 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  27.75 
 
 		 634 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  27.75 
 
 		 629 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  27.75 
 
 		 626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  27.57 
 
 		 626 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  28.4 
 
 		 1256 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 1256 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  24.01 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  24.01 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 1256 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  31.43 
 
 		 342 aa  137  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1096 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1253 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  25.8 
 
 		 1225 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  22.95 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  25 
 
 		 659 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  26.28 
 
 		 1431 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1433 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1433 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  25.44 
 
 		 672 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  22.68 
 
 		 672 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1042 aa  89  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  23.61 
 
 		 664 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1028 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  29.44 
 
 		 260 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.05 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.05 
 
 		 673 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  25.54 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  21.81 
 
 		 856 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1338 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  33.13 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  19.73 
 
 		 1257 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  23.73 
 
 		 637 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  25.21 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  29.75 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  29.84 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  20.67 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  20.18 
 
 		 898 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  27.47 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  38.1 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  29.3 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  37.14 
 
 		 624 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  34.81 
 
 		 704 aa  55.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  20 
 
 		 672 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  25.82 
 
 		 673 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  20.47 
 
 		 667 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  28.06 
 
 		 667 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  26.12 
 
 		 621 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>