139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2076 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
267 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  67.55 
 
 
268 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  67.55 
 
 
268 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  67.55 
 
 
267 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  69.8 
 
 
266 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  65.37 
 
 
266 aa  352  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  62.16 
 
 
266 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  63.81 
 
 
266 aa  344  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  61 
 
 
266 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  62.26 
 
 
267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  59.22 
 
 
266 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  57.98 
 
 
269 aa  321  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  63.04 
 
 
267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  58.04 
 
 
266 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  62.75 
 
 
267 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  63.14 
 
 
267 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  57.98 
 
 
267 aa  301  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  54.05 
 
 
287 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  51.34 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  53.23 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  52.53 
 
 
270 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  51.95 
 
 
271 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  51.34 
 
 
274 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  51.92 
 
 
273 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 
271 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  52.51 
 
 
264 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  53.39 
 
 
270 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  49.03 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  48.44 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  48.44 
 
 
265 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  48.28 
 
 
274 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  49.8 
 
 
344 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
267 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
285 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
267 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
267 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
267 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
267 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  49.01 
 
 
288 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  48.44 
 
 
265 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
271 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  49.22 
 
 
271 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 
266 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  47.86 
 
 
265 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  49.63 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 
265 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  51.56 
 
 
291 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  46.59 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  45.53 
 
 
263 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  43.56 
 
 
271 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  43.46 
 
 
277 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  43.65 
 
 
258 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 
271 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  42.05 
 
 
271 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  42.64 
 
 
270 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  39.69 
 
 
262 aa  201  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  40.71 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  40.84 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  44 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  40.4 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  40.78 
 
 
266 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  40 
 
 
266 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 
268 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  39.26 
 
 
285 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  41.22 
 
 
267 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  38.15 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  28.41 
 
 
296 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  28.81 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  29.34 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  27.05 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  28.67 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  28.67 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  25.83 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  26.45 
 
 
310 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  28.17 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  28.94 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  30.86 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  27.57 
 
 
296 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  25.42 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  29 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  32.45 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  24.45 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  30.38 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  26.89 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  26.89 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  26.69 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  25.2 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  25.2 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  27.07 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>