45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3755 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  100 
 
 		 1382 aa  2861    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  46.12 
 
 		 906 aa  631  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  46.87 
 
 		 900 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  31.87 
 
 		 1248 aa  282  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1463 aa  280  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  30.94 
 
 		 1258 aa  279  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  32.1 
 
 		 1255 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  32.01 
 
 		 1261 aa  271  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  30.77 
 
 		 1257 aa  270  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1543 aa  265  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1543 aa  260  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1252 aa  251  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1543 aa  251  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  30.44 
 
 		 1541 aa  249  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1553 aa  243  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1532 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  28.57 
 
 		 837 aa  234  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  28.96 
 
 		 1306 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  27.14 
 
 		 1072 aa  180  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1085 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  27.21 
 
 		 1168 aa  157  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  26.95 
 
 		 1537 aa  149  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1133 aa  129  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1576 aa  127  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1544 aa  117  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1504 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1508 aa  106  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  33.56 
 
 		 1581 aa  85.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  26.75 
 
 		 907 aa  78.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1202 aa  77.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  22.59 
 
 		 1008 aa  56.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  29.67 
 
 		 2215 aa  53.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1895 aa  53.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  32.98 
 
 		 423 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 		 765 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  32.99 
 
 		 969 aa  50.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  29.9 
 
 		 1206 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  27.56 
 
 		 918 aa  50.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  33.04 
 
 		 578 aa  49.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.76 
 
 		 1236 aa  48.9  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 		 1072 aa  48.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.53 
 
 		 766 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.08 
 
 		 14944 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  35.29 
 
 		 654 aa  46.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  27.88 
 
 		 978 aa  45.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>