More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0954 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  227  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  61.68 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  42.72 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  42.86 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  41.58 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  43.16 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  44.74 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  44.29 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  50.77 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  40.57 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  43.24 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.45 
 
 		 205 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  38.38 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  49.23 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.4 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  40.21 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.79 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 207 aa  67  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  36.19 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.37 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.95 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.86 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  44.12 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.66 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  40.96 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  36.89 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  43.37 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  41.79 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  34.62 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  40 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  39.18 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  30.93 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  38.24 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  33.62 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35.16 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  38.1 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  35.05 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  35 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  31.68 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  39.18 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  32.47 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  34.02 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.04 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  36.9 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  40 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  38.81 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  38.81 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  38.16 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>