More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0009 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  96.4 
 
 		 111 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  96.4 
 
 		 111 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  81.08 
 
 		 111 aa  187  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  55.17 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  50 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  45.12 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.6 
 
 		 222 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39.6 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  47.69 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  43.37 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.87 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  37.74 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  41.03 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  41.67 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  36.78 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  37.76 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  42.42 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35.09 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  36.89 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.78 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  32.2 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  45.59 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  33.6 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  34.62 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  34.62 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.76 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  36.17 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  39.51 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  35.79 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  40 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 200 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  34.78 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  31.93 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  38.81 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  33.62 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  41.33 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  36.89 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  36.89 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  38.96 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  36.49 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  41.33 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  41.33 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  35.79 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  41.33 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>