90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5802 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  779    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  65.27 
 
 
389 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  66.06 
 
 
383 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  66.32 
 
 
383 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  59.07 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  59.59 
 
 
386 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  58.44 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  58.33 
 
 
377 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  56.07 
 
 
386 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  44.74 
 
 
369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  48.36 
 
 
328 aa  305  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  30.85 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  31.19 
 
 
444 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 
484 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  31.35 
 
 
443 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  32.48 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  30.87 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  29.31 
 
 
435 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  29.76 
 
 
422 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  28.12 
 
 
461 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  30.28 
 
 
445 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  25.89 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  30.86 
 
 
455 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  30.22 
 
 
587 aa  116  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  32.09 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 
504 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 
494 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  30.67 
 
 
630 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  26.85 
 
 
560 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  54.24 
 
 
631 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  29.1 
 
 
624 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  31.48 
 
 
607 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  24.69 
 
 
587 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  26.27 
 
 
612 aa  59.7  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  29.48 
 
 
630 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  28.45 
 
 
739 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  24.66 
 
 
583 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  36.96 
 
 
625 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  22.62 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  32.54 
 
 
628 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 
633 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  27.03 
 
 
654 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  26.83 
 
 
631 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  27.03 
 
 
651 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  27.03 
 
 
678 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  27.03 
 
 
652 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  27.03 
 
 
678 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  27.54 
 
 
654 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  28.12 
 
 
653 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  28.21 
 
 
653 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  28.12 
 
 
653 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  25.58 
 
 
639 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  28.12 
 
 
653 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  27.54 
 
 
653 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  26.53 
 
 
715 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  29.06 
 
 
630 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  28.83 
 
 
640 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  29.77 
 
 
689 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  23.37 
 
 
593 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.79 
 
 
593 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  27.5 
 
 
653 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  30.72 
 
 
628 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  27.5 
 
 
653 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  27.5 
 
 
653 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  25.79 
 
 
629 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  24.43 
 
 
638 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  27.35 
 
 
653 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  26.67 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.37 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  27.35 
 
 
650 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  26.09 
 
 
651 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  27.35 
 
 
650 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  28.65 
 
 
663 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  25.86 
 
 
650 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2777  protein of unknown function DUF839  38.46 
 
 
641 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  25.49 
 
 
634 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  26.45 
 
 
678 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  33.85 
 
 
738 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1043  hypothetical protein  31 
 
 
691 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  30.47 
 
 
786 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  26.67 
 
 
688 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1040  hypothetical protein  31 
 
 
691 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  27.61 
 
 
659 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  28.15 
 
 
624 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1084  hypothetical protein  31 
 
 
691 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4183  hypothetical protein  40.35 
 
 
687 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  26.89 
 
 
662 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  27.61 
 
 
659 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  31.71 
 
 
476 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>