50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4895 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  43.55 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  40.71 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  32.8 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  33.87 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  33.87 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  33.87 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  33.07 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  33.04 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  34.27 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  34.45 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  34.07 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  32.77 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  30.65 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  33.1 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  29.5 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  32.19 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  28.31 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  28.31 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  34.97 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  28.31 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  32.45 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  31.01 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  33.9 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  26.45 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  38.71 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  26.9 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  26.92 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  25.37 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  24.14 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  34.62 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  27.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.28 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  29.71 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  25.66 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  29.06 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.85 
 
 		 157 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  25.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  30.88 
 
 		 431 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  28.69 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  28.7 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  23.91 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  33.09 
 
 		 537 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  25.43 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>