166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4040 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  57.87 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  62.43 
 
 
206 aa  241  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  55.88 
 
 
210 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 
210 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  44.66 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  44.33 
 
 
212 aa  179  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  44.17 
 
 
241 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.39 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  42.44 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  41.46 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  41.46 
 
 
210 aa  167  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  41.46 
 
 
210 aa  167  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  41.95 
 
 
210 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  41.46 
 
 
210 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.98 
 
 
210 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  45.25 
 
 
212 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  32.98 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  30.2 
 
 
208 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  36.53 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.2 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.73 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  30.9 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.9 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  30.9 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  29.78 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.31 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  29.19 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.71 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  28.16 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  31.55 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  33.91 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  31.45 
 
 
151 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.04 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  27.59 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  23.63 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 
331 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  23.63 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  33.59 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  23.63 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  33.87 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 
325 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  23.08 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
326 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  23.08 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  24.86 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  34.35 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  31.54 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
327 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  30 
 
 
172 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 
335 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  27.07 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  32.82 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  27.91 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  27.53 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  28.17 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  27.95 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  28.89 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  31.19 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.22 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  29.27 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  27.39 
 
 
321 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.27 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  26.52 
 
 
172 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  30.49 
 
 
326 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 
334 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 
321 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  30.12 
 
 
326 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  36.89 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  30.12 
 
 
326 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  28.33 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  28.33 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  28.33 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  28.33 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  28.33 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  28.83 
 
 
329 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 
358 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
332 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  41.67 
 
 
185 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.17 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.53 
 
 
199 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  35.16 
 
 
167 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  25.95 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  35.29 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
322 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  31.01 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  34.65 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  34.23 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  28.37 
 
 
184 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  34.86 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  32.81 
 
 
167 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>