82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2801 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  100 
 
 
145 aa  299  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  48.89 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  45.19 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 
153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  45.93 
 
 
232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  44.12 
 
 
205 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  42.36 
 
 
328 aa  130  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  44.68 
 
 
203 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 
152 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  42.66 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 
162 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  43.06 
 
 
158 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  41.48 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  39.71 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  42.66 
 
 
300 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  42.22 
 
 
272 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  38.97 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  38.97 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 
287 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  41.61 
 
 
337 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  39.01 
 
 
181 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  38.52 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  38.52 
 
 
217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 
212 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  38.19 
 
 
216 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  35.07 
 
 
330 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  32.35 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  30.88 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  28.36 
 
 
416 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
197 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  30.71 
 
 
303 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  27.74 
 
 
256 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  25.71 
 
 
394 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  27.97 
 
 
244 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
336 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  28.03 
 
 
217 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  30.82 
 
 
284 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  28.77 
 
 
238 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  30 
 
 
242 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 
241 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  30 
 
 
244 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  32.11 
 
 
232 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  29.33 
 
 
269 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
239 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 
219 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  23.48 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  23.4 
 
 
151 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  25 
 
 
240 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  30.91 
 
 
198 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  26.35 
 
 
231 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  26.03 
 
 
223 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  29.32 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  30.94 
 
 
214 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  24.14 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  24.11 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  22.31 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  28.37 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  27.66 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  24.31 
 
 
237 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  29.59 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  25.36 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  21.83 
 
 
152 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 
149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 
149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  20.95 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  23.4 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  22.79 
 
 
146 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  29.2 
 
 
147 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>