More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2550 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  100 
 
 
435 aa  863    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  63.74 
 
 
443 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  62.47 
 
 
457 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  58.22 
 
 
446 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  60.5 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  58.33 
 
 
450 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  56.04 
 
 
449 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  56.16 
 
 
455 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  56.18 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  54.09 
 
 
447 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  56.16 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  54.57 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  55.82 
 
 
480 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  57.76 
 
 
453 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  58.41 
 
 
473 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  62.14 
 
 
569 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  54.09 
 
 
468 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  49.66 
 
 
442 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  45.87 
 
 
448 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  43.36 
 
 
473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  40.45 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  40.45 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  40.45 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  40.45 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  41.6 
 
 
506 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  39.32 
 
 
453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  39.55 
 
 
453 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  39.32 
 
 
453 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  39.09 
 
 
453 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  39.09 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  39.09 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  38.86 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.16 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  39.73 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  43.63 
 
 
481 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  36.43 
 
 
449 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.42 
 
 
454 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  37 
 
 
458 aa  280  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  38.8 
 
 
461 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  33.48 
 
 
452 aa  259  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  41.03 
 
 
474 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 
494 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  38.8 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  32.63 
 
 
429 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  36.32 
 
 
570 aa  206  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  41.2 
 
 
579 aa  206  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.42 
 
 
457 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  35.06 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  35.63 
 
 
431 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  35.63 
 
 
431 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  35.63 
 
 
431 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  35.12 
 
 
446 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.88 
 
 
446 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  35.15 
 
 
442 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  36.38 
 
 
454 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  35.45 
 
 
427 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  34 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  33.02 
 
 
442 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  30.28 
 
 
441 aa  182  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.57 
 
 
445 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  31.46 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.63 
 
 
456 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.63 
 
 
456 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.96 
 
 
425 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.7 
 
 
424 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.41 
 
 
444 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.16 
 
 
445 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.71 
 
 
446 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.64 
 
 
464 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.57 
 
 
445 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  34.47 
 
 
431 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.26 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  32.16 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  30.39 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  32.08 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.24 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  33.74 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.07 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  32.08 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  32.56 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.7 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.85 
 
 
458 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.18 
 
 
429 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  32.48 
 
 
437 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  32.39 
 
 
456 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  31.22 
 
 
439 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  32.48 
 
 
440 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.01 
 
 
444 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  31 
 
 
474 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  32.25 
 
 
437 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.72 
 
 
442 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  34.84 
 
 
488 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  34.02 
 
 
430 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.95 
 
 
468 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  31.38 
 
 
444 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  31.58 
 
 
475 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.66 
 
 
449 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  31.58 
 
 
475 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.79 
 
 
428 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  33.1 
 
 
442 aa  170  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>