106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1836 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  36.23 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 
198 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
200 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 
199 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 
195 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  33.17 
 
 
291 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 
275 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.08 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  30.16 
 
 
311 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
200 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
411 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  42.19 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
274 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  26.42 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
212 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.73 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  21.15 
 
 
442 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
240 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
216 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2228  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
452 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  23.37 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  24.63 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.75 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  24.63 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  24.63 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  35.4 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  23.93 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  22.22 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  27.44 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  29.24 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.78 
 
 
442 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.57 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.57 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.78 
 
 
442 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.43 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.11 
 
 
443 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  29.29 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  22.44 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
205 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 
206 aa  42  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 
203 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  41.43 
 
 
169 aa  42  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 
242 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>