137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1011 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  64.09 
 
 		 301 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  44.86 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  41.78 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  43.95 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  38.7 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  35.47 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  35.02 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  26.05 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.62 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 147 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  30.84 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 161 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  35.48 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  30.67 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  30.61 
 
 		 109 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  24.4 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  28.43 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  32.63 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 129 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 129 aa  45.4  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 139 aa  45.1  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  34.48 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  31.96 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  32.47 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.14 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5725  transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.747282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>