48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0268 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  32.06 
 
 
327 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  33.57 
 
 
349 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  31.34 
 
 
341 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  34.74 
 
 
343 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  31.95 
 
 
321 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  30.58 
 
 
318 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  30.92 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  28.09 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  29.6 
 
 
351 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  29.94 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  30.48 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  28.61 
 
 
361 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  29.08 
 
 
383 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  30.04 
 
 
372 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  28.15 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  28.21 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  26.6 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  26.36 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  27.52 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.19 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  26.82 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  31.45 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  29.13 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  30.83 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  29.84 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  31.84 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  24.34 
 
 
365 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  25.52 
 
 
368 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  26.59 
 
 
363 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  25.61 
 
 
371 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.64 
 
 
361 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  29.27 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  27.89 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  27.78 
 
 
365 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  28.49 
 
 
359 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  27.27 
 
 
402 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  29.05 
 
 
411 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  29.44 
 
 
506 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  31.68 
 
 
316 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  26.88 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  25.08 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  27.78 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  27.03 
 
 
393 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>