152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3922 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  100 
 
 
85 aa  167  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  53.16 
 
 
81 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  53.16 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  50.6 
 
 
83 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  54.12 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  50.6 
 
 
83 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  55 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  51.9 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  48.75 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  50.63 
 
 
82 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  48.75 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  48.75 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  50.63 
 
 
82 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  49.4 
 
 
85 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  47.5 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  50 
 
 
83 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  47.5 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  47.5 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  51.9 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  48.72 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  51.9 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  49.37 
 
 
83 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  46.25 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  50 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  44.87 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  50.67 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  48.72 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  49.35 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  46.25 
 
 
82 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  45 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  46.15 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  46.91 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  47.44 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  47.44 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  46.15 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  46.75 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  42.68 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  43.59 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  48.19 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  33.75 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  32.91 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  37.66 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.84 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  35.44 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.38 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.38 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  33.8 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  32.88 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 
85 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  29.73 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  36.23 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  31.71 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  33.33 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  33.77 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  33.77 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  29.33 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  32.86 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  33.77 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  33.77 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  33.77 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  33.78 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  32.14 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  36.25 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  30.38 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  34.18 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  28.95 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  27.03 
 
 
79 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  31.71 
 
 
101 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0023  acyl carrier protein  32 
 
 
79 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  32.81 
 
 
77 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  28.05 
 
 
82 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  30.67 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  32.39 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  28.4 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  34.78 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  33.8 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  40.68 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  27.63 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  33.77 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  25 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  30.95 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  29.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  26.32 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  27.63 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  32.89 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  32.05 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  29.49 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  28.57 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  25.97 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  25.97 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  27.54 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  36.23 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  27.4 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  27.85 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1592  Acyl carrier protein  30.86 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0820426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  29.33 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  28.38 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>