More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3490 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  73.62 
 
 
489 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  75.47 
 
 
492 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  73.82 
 
 
489 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  71.16 
 
 
489 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  67.01 
 
 
491 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  976    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  75 
 
 
490 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  73.82 
 
 
489 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  75.47 
 
 
492 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  55.28 
 
 
492 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  56.47 
 
 
493 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.47 
 
 
493 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  53.15 
 
 
486 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.49 
 
 
484 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  53.21 
 
 
486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  54.3 
 
 
490 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  54.12 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  53.56 
 
 
491 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
483 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
491 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  53.59 
 
 
486 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  45.3 
 
 
486 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  43.12 
 
 
503 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 
491 aa  372  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
486 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 
486 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
480 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  43.06 
 
 
503 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
489 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 
497 aa  352  8.999999999999999e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
496 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 
496 aa  348  9e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
490 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
489 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
491 aa  342  9e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
485 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
497 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 
483 aa  339  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  41.27 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
510 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.07 
 
 
493 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  37.97 
 
 
510 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  37.55 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  37.24 
 
 
493 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
481 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 
481 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  42.39 
 
 
482 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40.97 
 
 
481 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
466 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
479 aa  293  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  42.82 
 
 
484 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.4 
 
 
496 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  40.5 
 
 
483 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
496 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.08 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  41.05 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  37.72 
 
 
498 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
505 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
483 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  40.82 
 
 
482 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
482 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
483 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  35.38 
 
 
477 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
466 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  36.29 
 
 
506 aa  276  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  38.49 
 
 
498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5100  Aldehyde Dehydrogenase  38.2 
 
 
480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482433  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
483 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  33.89 
 
 
499 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  38.93 
 
 
508 aa  273  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
482 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
497 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.38 
 
 
516 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
479 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  38.89 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
507 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
488 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 
486 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4389  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
482 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
507 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
507 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0902  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
491 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.864011  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1635  aldehyde dehydrogenase  40.14 
 
 
464 aa  266  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.766709  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
503 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  40.05 
 
 
481 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  34.92 
 
 
488 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.92 
 
 
488 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1759  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
448 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  36.75 
 
 
478 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  39.14 
 
 
488 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.71 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.91 
 
 
490 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
483 aa  263  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>