53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1019 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  52.35 
 
 
697 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  45.54 
 
 
672 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  52.36 
 
 
710 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  52.85 
 
 
699 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  52.93 
 
 
710 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  52.92 
 
 
707 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  52.93 
 
 
710 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  51.51 
 
 
676 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  52.27 
 
 
703 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  53.17 
 
 
703 aa  688    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  51.98 
 
 
703 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  52.42 
 
 
703 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  52.91 
 
 
680 aa  689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  50.15 
 
 
727 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  53.12 
 
 
677 aa  707    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  100 
 
 
683 aa  1395    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  52.93 
 
 
702 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  53.24 
 
 
684 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  52.21 
 
 
682 aa  706    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  47.88 
 
 
673 aa  611  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  45.52 
 
 
701 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  43.22 
 
 
693 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  43.71 
 
 
606 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  41.22 
 
 
711 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  41.11 
 
 
707 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  39.32 
 
 
726 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  39.14 
 
 
727 aa  505  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  38.89 
 
 
704 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  38.99 
 
 
700 aa  495  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.69 
 
 
728 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.62 
 
 
1255 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  32.96 
 
 
656 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.56 
 
 
682 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  26.98 
 
 
659 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.55 
 
 
655 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.98 
 
 
678 aa  234  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  29.69 
 
 
656 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  29.52 
 
 
679 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  26.22 
 
 
647 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  27.67 
 
 
648 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  27.19 
 
 
615 aa  203  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  29.87 
 
 
643 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.89 
 
 
629 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  28.97 
 
 
571 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25 
 
 
630 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.14 
 
 
674 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  28.57 
 
 
574 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.88 
 
 
641 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.83 
 
 
658 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  26.71 
 
 
661 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.2 
 
 
649 aa  106  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.83 
 
 
647 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  21.78 
 
 
648 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>