More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0697 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0697  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 316 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04579  exodeoxyribonuclease IX  76.75 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  48.06 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 930 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 926 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 928 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  36.75 
 
 		 928 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 888 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.65 
 
 		 934 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 930 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 893 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 892 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 1010 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 934 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 928 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2376  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  42.63 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 1014 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 935 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  36.46 
 
 		 979 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 945 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.3 
 
 		 940 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 929 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 935 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 1032 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.3 
 
 		 928 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  38 
 
 		 1021 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2057  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  38.97 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 896 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40 
 
 		 929 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  37.15 
 
 		 938 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 892 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 896 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 973 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 850 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.75 
 
 		 891 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 930 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 1033 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 916 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  37.3 
 
 		 1025 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  34.17 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 932 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 917 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 932 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 932 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 929 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 913 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  35.36 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 934 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 1020 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 909 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 895 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 902 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 928 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  34.74 
 
 		 932 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 915 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  34.6 
 
 		 892 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.03 
 
 		 908 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 928 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  35.46 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 928 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 915 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  35.82 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 928 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 928 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 928 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  42.52 
 
 		 921 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 915 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 979 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40 
 
 		 904 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 892 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  43.48 
 
 		 931 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 915 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 978 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 892 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 906 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.76 
 
 		 903 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 931 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1158  exodeoxyribonuclease IX  36.97 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0177587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 976 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  35.25 
 
 		 896 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 972 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 897 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 920 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 903 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 920 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 925 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 968 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 929 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 897 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 937 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 951 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>