More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4996 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  62.77 
 
 
523 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  100 
 
 
506 aa  1046    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  42.05 
 
 
493 aa  349  7e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  39.25 
 
 
522 aa  313  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  36.62 
 
 
507 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  37.57 
 
 
506 aa  289  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  35.28 
 
 
503 aa  276  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  35.59 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  34.58 
 
 
523 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  34.5 
 
 
526 aa  259  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  35.36 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  34.47 
 
 
526 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  33.01 
 
 
523 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  32.94 
 
 
520 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  34.56 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  33.14 
 
 
505 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.47 
 
 
486 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  31.44 
 
 
510 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.27 
 
 
480 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.8 
 
 
466 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.25 
 
 
497 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.48 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.49 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  32.88 
 
 
481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.92 
 
 
457 aa  196  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  28.38 
 
 
523 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.58 
 
 
501 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.81 
 
 
497 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  29.92 
 
 
440 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.91 
 
 
440 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.54 
 
 
497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.24 
 
 
497 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.45 
 
 
460 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  29.84 
 
 
488 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  33.24 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.98 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  30.55 
 
 
539 aa  173  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.06 
 
 
440 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  30.74 
 
 
468 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  28.29 
 
 
495 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  28.65 
 
 
462 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  29.96 
 
 
543 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.71 
 
 
472 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.74 
 
 
452 aa  170  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.18 
 
 
491 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.91 
 
 
458 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.79 
 
 
482 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.14 
 
 
500 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.79 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26.68 
 
 
480 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  29.42 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  28.73 
 
 
569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  29.59 
 
 
590 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.27 
 
 
492 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.69 
 
 
471 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  30.47 
 
 
556 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.69 
 
 
471 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  29.31 
 
 
555 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  30.57 
 
 
561 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  27.92 
 
 
457 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.29 
 
 
519 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.65 
 
 
553 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  29.2 
 
 
508 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  29.69 
 
 
569 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  28.08 
 
 
470 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.33 
 
 
548 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  30.06 
 
 
556 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.54 
 
 
481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.81 
 
 
453 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  28.9 
 
 
512 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  27.43 
 
 
724 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  27.69 
 
 
500 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  28.05 
 
 
510 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  28.51 
 
 
496 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  28.13 
 
 
505 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  28.29 
 
 
505 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  27.78 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  27.79 
 
 
638 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  27.16 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.06 
 
 
442 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.54 
 
 
479 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  29.33 
 
 
521 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.59 
 
 
536 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  26 
 
 
517 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  26.23 
 
 
467 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  27.44 
 
 
515 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  28.57 
 
 
547 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  29.78 
 
 
510 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  29.13 
 
 
525 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  28.34 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  26.1 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  28.44 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  28.05 
 
 
517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  28.23 
 
 
561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.07 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.22 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  28.61 
 
 
513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>