More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3410 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  64.1 
 
 		 202 aa  250  8.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  56.12 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  49.24 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  47.5 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  40.2 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  41.41 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  34.2 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  36.96 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  34.36 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  31.89 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  32.82 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.85 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.44 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  30.2 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  30.5 
 
 		 185 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  30.93 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  31.96 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  31.96 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  35.33 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31.84 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  29.9 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.37 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.37 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  32.09 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  35.71 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30.73 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  30.1 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  32.67 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  32.12 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.21 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.29 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31.14 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  30.57 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  31.93 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  28.08 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  30.15 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  32.7 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  29.05 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  28.71 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  29.63 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.5 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  27.08 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  30.39 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.61 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.92 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  28.21 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.08 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.63 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  28.21 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  29.84 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  29.84 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  29.84 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  27.8 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  28.21 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.61 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.61 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.61 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.19 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  30.05 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  28.21 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  30.77 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  28.1 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  40.22 
 
 		 98 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  30.11 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  30.77 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.06 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.33 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  30.11 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>