More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2236 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 343 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  45.29 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 789 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 789 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 789 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.27 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.08 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  25.95 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  29.56 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  26.94 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.71 
 
 		 694 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 475 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 475 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  26.36 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  30 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  29.2 
 
 		 422 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 433 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  27.62 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  27.12 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  25.62 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  27.12 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  27.12 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  27.12 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.27 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 1101 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.21 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 1120 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  21.34 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 1124 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.18 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.37 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.75 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  27.89 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.75 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>