41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1918 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  944    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  39.86 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  39.22 
 
 		 788 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  38.74 
 
 		 623 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  36.51 
 
 		 669 aa  190  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  40.07 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  35.74 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  35.71 
 
 		 679 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  38.16 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  34.93 
 
 		 712 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  29.94 
 
 		 713 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  30.5 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  27.27 
 
 		 351 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  26.64 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  28.34 
 
 		 294 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  29.5 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  27.03 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  29.69 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  29.2 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  30.18 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  34.67 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  28.29 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  41.67 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  28.14 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  34.46 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  39.13 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  28.42 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  29.9 
 
 		 588 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  34.74 
 
 		 859 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  31.9 
 
 		 559 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  35.45 
 
 		 693 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  37.78 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  24.81 
 
 		 924 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  31.25 
 
 		 1418 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1062 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1093 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  24.05 
 
 		 853 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  31.03 
 
 		 526 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  32.67 
 
 		 701 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>