More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1120 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1120  ABC transporter related protein  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.429709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  51.77 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  54.26 
 
 		 278 aa  305  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  48.58 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_002950  PG1010  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 		 275 aa  192  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.784964 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0586  ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.559058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.01 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.22 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  28.86 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  32.38 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.2 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  34.95 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  32.29 
 
 		 232 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  34.95 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  31.75 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  35.21 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  34.65 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  34.47 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  35.12 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  33 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  30.57 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  32.31 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  32.42 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  33.01 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.69 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  26.34 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  29.51 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.67 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  29.81 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  29.35 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  30.63 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.56 
 
 		 471 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  33.7 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  29.13 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  31.5 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  31.73 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.33 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  28.92 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  32.65 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  33.52 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.95 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  30.05 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.6 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  30.54 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  29.13 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  32.82 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  28.57 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  31.03 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.07 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  29.09 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  33.66 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  35.11 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  29.13 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  31.49 
 
 		 228 aa  99.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  31.79 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  33.17 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3535  ABC transporter related  31.37 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  32.29 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  30.98 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  31.46 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  30.26 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  33.02 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  29.67 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  28.57 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  32 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  28.38 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  30.39 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.49 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  31.96 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  32.47 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  32.81 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  36.2 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.53 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  31.68 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>