More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1107 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 360 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  79.1 
 
 		 363 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  76.39 
 
 		 360 aa  594  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  67.14 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.06 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.34 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 356 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  56.74 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  56.34 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  55.59 
 
 		 352 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  54.57 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  54.83 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  51.56 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  52.41 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.76 
 
 		 337 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.19 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.76 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.04 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.08 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  23.06 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  25.43 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.14 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 715 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.71 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  25.85 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  26.52 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  26.75 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.17 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.5 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  26.96 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  25.53 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  36.24 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  26.52 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  24.31 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  26.81 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  24.17 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  28.49 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  34.75 
 
 		 695 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.73 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.47 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.47 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.47 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.47 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  22.93 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  32.67 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.63 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.21 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 		 719 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.04 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.73 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5109  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0448384  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.69 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  24.4 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.73 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  25.24 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.2 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>