More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  38.35 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  39.08 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  36.11 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  36.11 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  36.11 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  39.69 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  36.24 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  36.24 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  42.75 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  43.12 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  37.06 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  37.6 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  40.21 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  40.21 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  39.42 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.72 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.23 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 296 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 299 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.11 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>