More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  74.3 
 
 
285 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  76.98 
 
 
289 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  72.13 
 
 
289 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  74.48 
 
 
299 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  72.41 
 
 
294 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3074  heat shock protein HtpX  71.53 
 
 
289 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3193  heat shock protein HtpX  70.75 
 
 
295 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal  0.244008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  70.91 
 
 
278 aa  357  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  62.59 
 
 
296 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  61.94 
 
 
292 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  62.81 
 
 
287 aa  348  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  61.67 
 
 
286 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  61.32 
 
 
291 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  61.32 
 
 
291 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  61.32 
 
 
291 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  59.58 
 
 
290 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  61.92 
 
 
283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  59.65 
 
 
286 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  58.95 
 
 
293 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  57.49 
 
 
290 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  59.86 
 
 
284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  63.06 
 
 
274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  56.9 
 
 
292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  56.6 
 
 
312 aa  318  5e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  57.5 
 
 
283 aa  318  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  63.9 
 
 
282 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  58.51 
 
 
289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  57.6 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  48.75 
 
 
296 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  48.4 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  47.69 
 
 
285 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
282 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  47.33 
 
 
285 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  46.95 
 
 
283 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  48.04 
 
 
285 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  46.79 
 
 
285 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  48.21 
 
 
286 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  48.75 
 
 
286 aa  254  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  46.43 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  46.43 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  46.43 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  47.86 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  47.5 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  45.71 
 
 
288 aa  251  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  46.43 
 
 
285 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  46.43 
 
 
285 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  45.74 
 
 
280 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  54.62 
 
 
287 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  43.88 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  47.14 
 
 
286 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  45.26 
 
 
282 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  46.57 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  45.91 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  44.17 
 
 
316 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  45.16 
 
 
307 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  44.83 
 
 
282 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  45.39 
 
 
313 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  45.39 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  46.53 
 
 
287 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  46.98 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  47.91 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  45.13 
 
 
287 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  42.5 
 
 
320 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  44.9 
 
 
296 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  45.98 
 
 
285 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  42.55 
 
 
320 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  48.4 
 
 
280 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  48.7 
 
 
287 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  48.75 
 
 
280 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  50.21 
 
 
285 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  46.15 
 
 
283 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  45.83 
 
 
300 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  46.92 
 
 
286 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  44.17 
 
 
315 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  50.36 
 
 
307 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  45.83 
 
 
300 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  42.91 
 
 
285 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  42.23 
 
 
343 aa  225  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0007  peptidase, M48 family  41.96 
 
 
292 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  44.48 
 
 
325 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  44.48 
 
 
325 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  52.84 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  45.93 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  47.03 
 
 
324 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  53.51 
 
 
307 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  44.13 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  40.85 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  47.23 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  45.25 
 
 
296 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  45.55 
 
 
299 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  44.24 
 
 
307 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  44.48 
 
 
296 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>