More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  100 
 
 		 433 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  44 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  37.38 
 
 		 431 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.42 
 
 		 730 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  30.49 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.71 
 
 		 723 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.73 
 
 		 730 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  27.07 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.7 
 
 		 738 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  27.71 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  26.86 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  24.31 
 
 		 465 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.79 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  28.32 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  27.91 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  26.26 
 
 		 440 aa  86.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  26.17 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  23.23 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  27.42 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  21.15 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  26.53 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  26.68 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  28.09 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  24.2 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  29.05 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  28.21 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  22.86 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  29.86 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  25.65 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  24.52 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  28.31 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  24.93 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  22.79 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  26.72 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  25.78 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  26.93 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  27.34 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2850  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.73 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  27.18 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2987  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  26.28 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  26.48 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  27.11 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  26.7 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  25 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  25.55 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  26.3 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  24.81 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  26.37 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  21.05 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  22.72 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  20.7 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  24.59 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  25.27 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  25.44 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  22.91 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  22.38 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  24.11 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  26.96 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1210  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.5 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  25.13 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  21.61 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  36.84 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  26.41 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  20.2 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  25.42 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  35.77 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.77 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  29.77 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  20.53 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  23.96 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  23.14 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  27.17 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  20.46 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  22.9 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  25.71 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  25.72 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  25.39 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  21.63 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  25 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  22.14 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  26.29 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  26.3 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  24.35 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  34.5 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>