More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2850 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2987  glycoside hydrolase family protein  98.68 
 
 		 472 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2850  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 453 aa  926    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  65.68 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  65.68 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  58.66 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  42.79 
 
 		 482 aa  324  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  39.78 
 
 		 458 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  41.55 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  40.71 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  40.14 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  42.12 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  38.88 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  40.56 
 
 		 472 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38.41 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  40.48 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  41.56 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  38.08 
 
 		 474 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  40.05 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  38.11 
 
 		 463 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  37.23 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  37.44 
 
 		 474 aa  289  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  40.09 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  40.97 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  38.43 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  39.47 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  38.21 
 
 		 476 aa  286  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  38.65 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  39.87 
 
 		 448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  38.66 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  40.27 
 
 		 453 aa  282  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  41.22 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  38.63 
 
 		 467 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  38.18 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  36.83 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  36.7 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  37.61 
 
 		 472 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  41.24 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  37.08 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.9 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  35.07 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  38.14 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  37.61 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  37.17 
 
 		 478 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  39.82 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  36.26 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 473 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  37.1 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  38.58 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  33.18 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  33.48 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  41.15 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  38.25 
 
 		 500 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  36.96 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  38.44 
 
 		 474 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  37.11 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  34.4 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  39.14 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 478 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  36.72 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  34.4 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  35.75 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  35.52 
 
 		 457 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  36.11 
 
 		 487 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  39.73 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  37.28 
 
 		 463 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  32.89 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  36.18 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  36.78 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  35.46 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  38.58 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  35.48 
 
 		 467 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  39.14 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  37.7 
 
 		 470 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  38.11 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  38.49 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  37.64 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  37.58 
 
 		 494 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  34.32 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  37.21 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  38.22 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  38.05 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  37.19 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  32.88 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  32.71 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  36.55 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  37.41 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  34.57 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  34.82 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  31.57 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  34.74 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  36.01 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  33.96 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  33.1 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  36.99 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  35.67 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  31.57 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.26 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  33.19 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  34.25 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>