81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4377 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  97.89 
 
 		 331 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  100 
 
 		 371 aa  769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  30.46 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  30.46 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  30.46 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  30.16 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 399 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  28.25 
 
 		 649 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  25.45 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  25.26 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  27.02 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  26.17 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  25 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  27.41 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02045  Site-specific recombinase XerD-like protein  23.77 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.317068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  23.99 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  26.24 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  26.12 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  26.56 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  24.67 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  28.19 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  25.87 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  22.64 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  24.12 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  25.5 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  25.37 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  25.37 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  24.74 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  24.6 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  23.62 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  26.77 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  25.77 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  23.25 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  23.25 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  23.56 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  25 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  25.65 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  24.91 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  24.91 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  26.09 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  22.87 
 
 		 313 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  22.87 
 
 		 313 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  24.31 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  22.76 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  23.36 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  22.44 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  23.58 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  22.29 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  27.22 
 
 		 363 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  20.97 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  28.86 
 
 		 189 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2751  hypothetical protein  36.21 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000220273  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  25.15 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  45.95 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  27.27 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  24.59 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  24.67 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  28.24 
 
 		 197 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 207 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  39.53 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>