More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4305 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 388 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1223  methyl-accepting chemotaxis protein  38.44 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0105  MCP-domain signal transduction protein  33.78 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000762426  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 633 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 656 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 650 aa  125  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 541 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  38.94 
 
 		 566 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  31.17 
 
 		 626 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 563 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  28.15 
 
 		 656 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 708 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  40.1 
 
 		 713 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 650 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  37.81 
 
 		 661 aa  112  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.8 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  30.92 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  28.9 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 812 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  38.39 
 
 		 516 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 539 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 539 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  29.44 
 
 		 625 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 620 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 		 568 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 		 554 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 		 497 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 658 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.24 
 
 		 530 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 682 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 648 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.98 
 
 		 554 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 554 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 554 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 		 590 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0675  methyl-accepting chemotaxis protein  47.83 
 
 		 542 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0486909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 554 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.65 
 
 		 607 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 530 aa  106  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  37.88 
 
 		 651 aa  106  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 554 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 667 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 661 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 620 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.58 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 545 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 674 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 		 492 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.36 
 
 		 492 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407863  hitchhiker  0.000000143908 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3459  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 		 492 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000558964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 		 720 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 		 589 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 601 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 545 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 		 526 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.19 
 
 		 555 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 		 603 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.774772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 545 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 554 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 554 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.5 
 
 		 538 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  39.76 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 672 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0796  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 		 620 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1881  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 592 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 		 534 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 667 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 667 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  51.61 
 
 		 521 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  57.14 
 
 		 657 aa  102  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  57.14 
 
 		 678 aa  102  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 667 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  42.38 
 
 		 771 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  57.14 
 
 		 660 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  30.9 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 667 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0349  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 585 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 667 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>