More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0105 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0105  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 		 381 aa  748    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000762426  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1223  methyl-accepting chemotaxis protein  57.45 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 708 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 621 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 499 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 713 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 650 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 		 546 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 720 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 627 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  42.05 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  41.26 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  58.24 
 
 		 553 aa  106  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 604 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  50.43 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  50.43 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  50.43 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 530 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 626 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  36.11 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.38 
 
 		 686 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.87 
 
 		 660 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 658 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 682 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.42 
 
 		 544 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 775 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 		 650 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2843  chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.565523  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 675 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.870162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 625 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  42.96 
 
 		 663 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 633 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 560 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 		 635 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29 
 
 		 564 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  40.12 
 
 		 731 aa  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  53.85 
 
 		 604 aa  103  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  36.57 
 
 		 600 aa  102  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 		 601 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 603 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  31.93 
 
 		 584 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  45.13 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 541 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  41.91 
 
 		 651 aa  102  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  32.73 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2182  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.74 
 
 		 592 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  41.06 
 
 		 666 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 771 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000170719  normal  0.104593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.876228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.246306  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 		 656 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  57.83 
 
 		 655 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  31.58 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.93 
 
 		 528 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 677 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  33.63 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.59 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 720 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 		 632 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 536 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0038  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 581 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.36998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  32.79 
 
 		 672 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  44.53 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.17 
 
 		 592 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.334447 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  48.21 
 
 		 654 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  57.83 
 
 		 655 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  48.21 
 
 		 656 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  54.35 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  54.35 
 
 		 652 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  54.35 
 
 		 545 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.93 
 
 		 653 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  25.08 
 
 		 541 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 		 678 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85269 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  34.76 
 
 		 626 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  44.8 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.76 
 
 		 720 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  32.96 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  57.83 
 
 		 654 aa  100  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  46.15 
 
 		 690 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0349  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.24 
 
 		 585 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 		 590 aa  99.8  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  27.55 
 
 		 656 aa  99.8  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 		 660 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 		 748 aa  99.8  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 541 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 667 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 832 aa  99.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0356  chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 652 aa  99.4  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 		 670 aa  99.4  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 		 563 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>